厭氧污泥消化法除了溶解的有機物之外，相當大的浮游物亦可被酸生成菌所分解。所生成的低級脂肪酸再由甲烷菌的作用變成甲烷氣、二氧化碳、氨等氣體類及少量的消化污泥。